Une analyse complète du microbiote intestinal en 6h30
12 juin 2025 - La biotech Perseus Biomics (Louvain) a mis au point une technologie intelligente, baptisée 'MetaMAP', qui permet de cartographier l’ensemble du microbiote intestinal en 6 heures et demie.
Révolution en marche dans l’étude de la flore intestinale humaine? C'est en tout cas ce qu'annoncent les firmes belges Perseus Biomics et Comate, qui lancent 'MetaMAP', une machine (photo ci-contre) qui permet de sortir, en 6h30, un rapport complet et détaillé de toutes les bactéries intestinales (et avec leur quantité exacte). "Là où cette analyse était avant chronophage et complexe, ou ne délivrait qu’un instantané partiel, MetaMAP rend désormais l’analyse rapide et complète du microbiote accessible aux chercheurs et aux entreprises du monde entier", se réjouissent les deux société dans un communiqué.
Une autre approche de l'analyse ADN
C'est Perseus Biomics qui a imaginé la technologie intelligente pour arriver à "cartographier" l’ensemble du microbiote. De son côté, Comate, spécialisée dans le développement et la production de matériel pour le secteur life sciences (entreprises, unifs, start-ups), a "traduit" la technologie en un appareil compact (60 x 70 x 50 cm, 60 kg), évolutif, pour exécuter le processus d’analyse. L'union des deux donne 'MetaMap'.
L'idée de développer une technologie de cartographie de la flore intestinale a débuté à la KU Leuven et à l’EPF de Lausanne. Puis, en 2020, est née Perseus Biomics. L’innovation réside dans une nouvelle approche de l’analyse de l’ADN : au lieu de séquencer l’ADN lettre par lettre, Perseus applique des marqueurs lumineux sur des segments spécifiques, les molécules d’ADN bactérien deviennent ainsi fluorescentes, formant un motif lumineux unique pour chaque espèce bactérienne. "Ces motifs sont ensuite photographiés, puis interprétés par des algorithmes avancés pour identifier les bactéries présentes et quantifier leur concentration", explique la firme.
Un outil pour la médecine, mais pas seulement
On le sait, l'état de la flore intestinale est désormais associé à diverses pathologies, de l'obésité à la dépression en passant par certaines maladies chroniques. "Nous pouvons à présent cartographier le monde microbien avec une rapidité et une précision inégalées", se félicite Arno Bouwens, directeur R&D chez Perseus Biomics. "Ce qui peut considérablement accélérer le développement de traitements et de médicaments ciblés."
Le microbiote peut servir de biomarqueur pronostique pour des maladies comme les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI), prédire le succès de traitements notamment contre le cancer, voire servir de futures transplantations de microbiote fécal chez les patients souffrant d’infections à Clostridium difficile.
Au-delà des diagnostics purement médicaux, l'analyse du microbiote, de façon simple et rapide, ouvre également la voie à des conseils nutritionnels personnalisés pour le grand public, voire à l’optimisation des stratégies d’entraînement des athlètes de haut niveau.
MetaMAP offre également de nombreuses possibilités pour le monde de l'industrie agro-alimentaire. Les bactéries jouant un rôle clé dans la fabrication de nombreux aliments, l’appareil pourrait être utilisé pour effectuer des contrôles qualité dans le processus de production de produits comme la bière, les yaourts ou le levain, "mais aussi pour mesurer précisément l’impact des aliments sur notre bien-être", précise encore le communiqué. L’appareil peut analyser jusqu’à huit échantillons en parallèle. Le nombre de souches bactériennes qu’il peut identifier est, par ailleurs, illimité. Ces deux facteurs ouvrent la voie à une productivité accrue et, du coup, à une réduction des coûts opérationnels pour les utilisateurs.
